兰州大学南通基地是兰州大学下设的教育基地，于2014年由兰州大学与江苏省南通市政府合作创办。

2014年12月11日，兰州大学与江苏省南通市政府签订战略合作协议，积极响应国家“一带一路”及“长江经济带”建设重要机遇，充分发挥双方在经济、教育、科技、人才方面的优势，建立长期、稳定和全面的人才培养及校地合作关系，更好地促进南通经济社会发展和兰州大学高水平研究型大学建设。

2014年10月30日，兰州大学南通基地正式成立。南通基地的建立，旨在促进学校融入“一带一路”和“长江经济带”国家战略，借助长三角地区独特的区位优势和经济发展优势，建设学校产学研一体化平台，为在校学生提供良好的创新创业实践平台。南通基地以全日制专业硕士研究生实习实践基地为起步，开展多层次人才培养，将逐步建设研究院、省部级重点实验室等系列科研机构，孵化发展相关科技产业。计划在5年内建成学生实习实践、产学研结合的重要平台，中远期将着力建设高层次中外合作大学。

2015年，为提高学校专业学位研究生培养质量，造就高层次、专业应用型人才，学校决定，法学院、经济学院、哲学社会学院、外国语学院2015级专业硕士学位研究生、新闻与传播学院2014级专业硕士研究生共计331人到兰州大学南通基地报到，按照人才培养方案中的有关内容进行2015—2016学年秋季学期教学及实践培养。

2016年，数学与统计学院、公共卫生学院专业研究生春季学期入驻南通基地，同时南通基地建立沿海滩涂生态工程研究所，同步实现学生教学实践和产学研合作。秋季学期，全校将有30个领域800名专业学位研究生入驻南通基地进行教学实践。此外，还将积极推动兰州大学信息科学、管理科学和大学科技园分院项目落地，全力推进英、法、德等国高水平大学开展中外合作办学，力争取得实质性突破。