公安部第三研究所是中华人民共和国公安部下属的以研究信息网络安全技术、物联网技术、特种通讯技术、禁毒技术、反恐防爆技术、图像处理及传输技术和社会公共安全防范技术为主的高科技、多学科的综合性研究所。

1978年，上海公安科学研究所成立。

1979年，经中华人民共和国国务院批准更名为公安部上海八七六研究所。

1984年，经中华人民共和国公安部批准更名为公安部第三研究所。

2005年，由公安部第三研究所全资设立的办学机构上海海盾安全技术培训中心成立。

2013年，在中华人民共和国公安部的支持下，国家反计算机入侵和防病毒研究中心（依托公安部第三研究所设立）获中华人民共和国人力资源和社会保障部批准，成为第三批国家级专业技术人员继续教育基地。

2015年，公安部第三研究所（认证中心）由中国国家认证认可监督管理委员会和中华人民共和国公安部批准成立，其法律母体是公安部第三研究所。

2019年4月，公安部第三研究所当选上海市信息通信行业协会第六届副会长单位。

2020年9月，公安部第三研究所与日海智能科技股份有限公司在上海举行公共安全智能物联实验室联合建设签约暨揭牌仪式。

2022年7月，公安部第三研究所与南宁市大数据发展局联合成立了大数据安全实验室。

据2024年3月研究所官网数据，公安部第三研究所拥有一支2200多人的科研、管理和支撑队伍，其中专业技术人员1900余人，700多人具有硕士博士学位。

公安部部级津贴人员：杨涛

新一届“上海工匠”：董育娟

据2024年3月研究所官网数据，公安部第三研究所拥有18个业务部门、6个所属公司，拥有一批国家级、省部级创新平台。

国家工程实验室：网络事件预警与防控技术国家工程实验室、信息安全等级保护关键技术国家工程实验室、大数据协同安全技术国家工程实验室

国家级研究中心：国家反计算机入侵和防病毒研究中心

国家级质量监督检验中心：国家网络与信息系统安全产品质量监督检验中心

公安部重点实验室：信息网络安全公安部重点实验室

公安部产品检测中心：公安部信息安全产品检测中心

公安部评估中心：公安部信息安全等级保护评估中心

所属业务部门：网络安全技术研发中心、网络侦查技术研发中心、物联网技术研发中心、特种技术研发中心、数据安全技术研发中心、检测认证中心、网络安全等级保护中心、密码技术处、经侦技术处、情报指挥技术处、禁毒技术处、安全防范技术处、信息安全技术处、数据警务技术处、公共安全技术处、西北技术服务中心、教育和评价中心、《信息网络安全》杂志社

所属公司：上海国际技贸联合有限公司、上海辰锐信息科技有限公司、北京锐安科技有限公司、上海公共安全器材有限公司、上海网盾智能科技发展有限公司、上海海盾安全技术培训中心

2020年12月18日，公安部第三研究所与格尔软件有限公司在上海签署战略合作协议。

2021年5月12日，公安部第三研究所与中国人民公安大学在北京举行战略合作框架协议签约仪式。

2022年1月25日，公安部第三研究所与上海文鳐信息科技有限公司在上海签署网络与数字安全产学研用合作协议。

2022年6月30日，公安部第三研究所与上海亿通国际股份有限公司在浦东张江签署战略合作协议。

据2024年3月研究所官网数据，公安部第三研究所先后承担国家各类科研项目近80项，中华人民共和国公安部等省部级项目90项，获国家科技进步奖励3项，省部级科技奖励16项；发布国际国家标准19项，行业标准50项，发表SCI论文160余篇，获发明专利授权130余项。

《信息网络安全》创刊于2001年，是由中华人民共和国公安部主管，公安部第三研究所、中国计算机学会计算机安全专业委员会主办，面向中国国内外公开发行的中国国内首批网络安全类期刊之一，为中文月刊。主要涉及领域包括密码理论与身份认证、安全体系与协议安全、软件安全与可信计算、等级保护与风险评估、网络攻防与漏洞分析、电子取证与数据挖掘、应用系统安全与容灾备份、新技术新应用与新安全等。

据2024年3月研究所官网数据，公安部第三研究所拥有“一分院五基地”教育培训评价品牌，包括：“全国公安教育训练网络学院网络安全分院”“国家级专业技术人员继续教育基地”（中华人民共和国人力资源与社会保障部）、“公安部网络警察培训基地”“上海市信息安全高技能人才培养基地（实施单位）”“中国网络空间安全协会培训基地”、第45届及第46届“世界技能大赛网络安全项目中国集训基地”。

公安部第三研究所所徽为统一使用的中国人民警察警徽，该警徽图案由中华人民共和国国徽、盾牌、长城、松枝和飘带构成，是人民警察的象征和标志，人民警察必须爱护警徽，维护警徽的尊严。

2019年5月17日，公安部第三研究所第五届职工运动会在卢湾体育场开幕。