区别在于所有者权益是剩余权益，在偿还了债权人权益后，剩余部分才是所有者权益。债权人权益是企业债权人对企业全部资产的要求权；而所有者权益是企业投资者对企业净资产的要求权。可见，债权人对企业资产的要求权优先于所有者。当企业进行清算时，在支付了破产、清算费用后将优先用于偿还负债，如有剩余资产，才能按比例返还所有者。
所有者权益和债权人权益都是公司资金来源的途径，它们都是公司资金的所有者，目的都是希望能够从与公司的交易中获得收益。但是公司债权人和公司股东又是两种性质不同、权利义务有别、法律地位迥异的利益主体。公司股东是公司的所有人，具有所有者的资产受益、重大决策和选择管理者等权利。公司债权人则被公司法看作是契约法上的一种请求权人，他们除了依据与公司的契约上所规定的权利之外，对于公司的事务不得享有更多的权利。具体而言，股东权益和债权人权益的差别主要体现在：
1．股东权益与债权人权益在公司经营中所处的地位不同。债权人与公司之间只是存在债权债务关系，他们无权参与公司的日常经营活动，我们可以将债权人权益称为“不参与权益”。而股东凭借其所拥有的权益可以直接参与公司的经营管理，也可以委托他人间接进行经营管理，我们可以将股东权益称为“参与权益”。
2．股东权益和债权人权益各自承担的风险不同。从财产求偿权来看，债权人权益优先于股东权益。债权人权益是以公司全部资产为要求对象的，而股东权益是对全部资产扣除负债后的净资产的所有权，是一种剩余权益。另一方面，在公司的解散清算过程中，债权人权益也排在所有者权益之前。与风险承担相吻合，债权人权益要求的报酬率一般低于股东权益要求的报酬率。不管公司经营状况如何，债权人的
权益报酬率是相对稳定的，除非公司资不抵债。而所有者权益的报酬率则随着公司经营业绩的变化而变化：当公司经营业绩好时，所有者权益的报酬率就高，反之则低或者为零，甚至会损失初始的投入资本。
3．两种权益的偿还期限不同。股东权益在公司经营期内除依法转让外不得抽回资金，股东权益只有在清算后尚存剩余财产时才有可能补偿投入资本。而债权人权益有确定的偿付日期，公司到期必须足额偿付利息和本金，否则将面临破产清算的风险。