保护海上交通线作战是伴随海上破交行动而产生的。进入16世纪，为了应对敌方的破交行动，许多国家开始组织战斗舰艇编队为海上运输船队护航。
第一次世界大战期间，大量军队、物资和装备需从海上运送，英国海军为打破德军潜艇对海上交通线的破击，先后动用大量兵力投入保交作战，反潜战成为大西洋保交战的主要样式。
第二次世界大战期间，海上运输量的急剧增大和远程航空兵的出现，促使远、近程结合的纵深立体保交作战的产生。1941～1942年，英军在地中海航线选用快速运输船只，组织强大的海空警戒和掩护兵力护航，并突击德、意海军基地，拦截来袭兵力，保障运输队安全。第二次世界大战后的多次局部战争中，交战国都十分重视保护海上交通线。1982年
马尔维纳斯群岛战争中，英国海军有效地保护了英国本土到马尔维纳斯群岛（福克兰群岛）1万余千米的海上交通线，为夺取战争胜利发挥了重要作用。
保护海上交通线战役，以确保海上交通运输为目的，作战行动受运输行动制约；防御正面宽、纵深大，持续时间长，保护对象多，战役任务艰巨，行动处于被动地位。基本要求：①以运输行动为中心，统筹安排防卫、掩护和保障。②重点使用保交兵力，将主要兵力兵器用于威胁较大的海域和关键时节，保护重要目标。③集中运输与分散运输相结合，伴随护航与区域护航相结合，灵活运用护航方式。④贯彻积极防御思想，以积极的攻势行动，对可危害之敌进行攻击，削弱、限制敌破交能力。⑤积极采取佯动、伪装等方法和措施，保持运输行动的隐蔽性。⑥积极创造条件，与盟国协同或争取友好国家支援。
保护海上交通线战役根据任务、敌情和海区情况，通常由海军兵力单独组织实施；有时也可与其他军种和盟国兵力联合实施。基本方法有：根据运输任务，针对敌可能的破交行动，周密制定计划；正确选定航线，确定运输方式；实施隐蔽伪装，并组织兵力进行护航；采取进攻手段，打击、削弱或封锁敌破交兵力；根据不同情况，适时变换队形或规避航行；当遭敌袭击时，集中兵力进行抗击，大量杀伤敌人，减少己方损失。
未来
信息化战争中，保护海上交通线战役将占据重要地位，将形成海陆空一体的保交体系，作战规模进一步扩大，保护装卸港口安全将成为战役的重要内容。