纵向集成是一个组织拥有一个供应链各个部分的方法。一个高度纵向集成的企业，可以控制从原料准备到产品零售的全部行动。例如，像阿莫克这样的石油公司。对纵向集成的一种看法是，认为提高企业的纵向集成度可以使组织在买卖交易市场中的交易成本降到最低，它对于更好地控制物流、交流信息和降低成本有利。但是反过来，拥有全部所有权并不能保证可以为顾客提供更好的服务，甚至不能迅速了解外界的变化。此外，纵向集中度高的企业往往组织庞大，管理机构复杂，这是导致反应速度慢的重要原因之一。
决定不对链中的所有环节均持有所有权，意味着
供应链是由原材料供应商、生产商、批发商、运输商以及零售商等多个企业组成的联盟。在一个自由市场的环境下，这样的合作者可以通过一次简单交易获得。但是寻找一个合适的供应商，并且双方对价格和其它细节达到一致需要企业付出交易成本。而且，如果双方只是为了进行这一交易则每一方均希望尽可能大地获得收益并降低所有成本。反过来，如果认识到一个稳定的供应链有可能使链上的各个企业从多次交易中获得收益，获得纵向集成可以带来的好处，企业就会首先注重合作关系的建立，而不是通过谈判来试图迅速得到收益。一旦双方之间树立起了良好信誉，则双方的反应速度均会提高，因为双方已经没有必要花费时间在每一次交易中重新达成一致意见。只要经营需要，双方就可以立刻进行某些交易。
在纵向集成与企业间的联盟之间，还可以有许多混合形式。例如，通过企业集团寻求中小企业与大企业配套和专业化协作的途径。在现实中，很多产品和生产工序都有专用化的设备和工艺。考虑到资源配置的效率，大型企业不需要成为每道工序都设在本企业、每种中间产品都在本企业生产的全能企业，即纵向集成度很高的企业；中小企业也不一定有能力提高自己的纵向集成度。因此，通过企业集团的形式，可以使大企业与中小企业合理分工，各施所长，按照整个供应链的流动进行配套和协作。日本某些大企业采用的供应商网络的“系列”，就是类似这样的企业集团。在这样的“系列”中，通常由互相参股的多个企业组成，其中既有银行、大型企业等作为“旗舰”企业，也有提供零部件和各种配套服务的中小型企业。在“系列”中，各个企业互相支持，尤其是大企业，对“系列”中的提供资金、技术、人员培训等多方面的支持。