余玠赴任后，革除弊政，实行轻徭薄赋、整顿军纪、除暴奖贤、广纳贤良、聚小屯为大屯等政策。采纳播州人冉氏兄弟建策，采取依山制骑、以点控面的方略，先后筑青居、大获、钓鱼、云顶(今四川
南充南、苍溪东南、合川东、金堂南)等10余城，并迁郡治于山城。又调整兵力部署，移金州(今陕西安康)戍军于大获；移沔州(今陕西略阳)戍军于青居；移兴元(今陕西
汉中)戍军于
合州(今合川东
钓鱼城)，共同防守内水(今
涪江、
嘉陵江、
渠江)；移
利州戍军于云顶，以备外水(即岷江、
沱江)。
诸城依山为垒，据险设防，屯兵储粮，训练士卒，经数年建设，逐步建成以重庆为中心，以堡寨控扼江河、要隘的纵深梯次防御体系，边防稍安。
淳祐六年(蒙古贵由元年)，蒙古分兵四道入蜀，
余玠继多次战胜蒙古军进攻之后，依靠新建立的山城防御体系，又打退了蒙古军的进攻。十年(蒙古海迷失皇后二年)，
余玠调集四川各路精锐，誓师北伐。以一部兵向陇蜀边界出击；自率主力，取
金牛道向汉中(今属陕西)进发，三战连捷。
次年四月，
余玠率军号10万进占汉中西之中梁山，潜军烧毁汉中至
大散关(今陕西
宝鸡西南)栈道后，率军围汉中数重，昼夜急攻。蒙古军修复栈道，各路援军会至。
余玠久攻不克，兵老师钝，只好撤军。十二年(蒙古
蒙哥汗二年，1252年)，
余玠率军击退进攻嘉定(今四川乐山)的蒙古军，四川抗蒙形势日益好转。
余玠守蜀，针对蒙古军骑术精良，善于野战的特点，采取守点不守线、联点而成线的方略，利用山险制骑，改变了被动挨打的局面，屡败蒙古军，为以后抗蒙作战奠定了良好基础。
余玠（1199—1253），字义夫， 蕲 州人（治今湖北蕲春东北），
南宋名将。 端平三年（1236），赵葵任淮东安抚制置使兼扬州（今属江苏）知州后，
余玠晋谒，被留置幕府。
嘉熙二年（1238）正月，任
招信军（今安徽嘉山东北）知军兼淮东制置司参议官。
嘉熙四年（1240），
余玠率水军由运河进攻至开封有功，升任淮东提点刑狱，后又兼淮安知州、淮东制置司参谋官。
淳祐元年（1241），又以率军援救
安丰（今安徽
寿县）有功，升任淮东制置副使。