并为该校唯一由神学院、比较文学系、英文系、东亚系及社会思想委员近四十年，余国藩也是
台湾中央研究院及美国国家人文科学的院士，并荣任中央研究院中国文哲研究所通信研究员。
余国藩向以英译《西游记》（Journey to the West，四册）饮誉学界，在《重读石头记》及各类论文之外，他另有《重访巴拿撒斯山》（Parnassus Revisited：Modern Critical Essays on the Epic Tradition）及《信仰的语形学》（Morphologies of Faith：Essays in Religion and Culture in Honor of Nathan A. Scott，Jr.）、《余国藩西游记论集》、《重读石头记：里的情欲与虚构》、《从历史与文本的角度看中国的政教问题》等著作及若干论文。