云南省东南亚南亚研究院成立于2006年。它是根据省委指示而成立的整合全省东南亚南亚研究力量和资源的
专业研究机构。
该院的宗旨是，在中共云南省委、云南省人民政府的领导下，以马克思主义为指导，根据国家外交方针和对外政策，对东南亚、南亚问题进行多学科、全方位的研究，为中央和省委、省政府科学决策服务，为促进中国和云南与周边国家睦邻友好关系的发展，推进国际次区域合作，促进对外开放、巩固和稳定边疆服务，为繁荣发展哲学社会科学、全面建设小康社会服务。
工作目标是努力把东南亚南亚研究院建设成为我国一流的东南亚南亚研究的学科基地，成为为我国、我省对外开放服务的决策咨询基地，成为与东南亚、南亚国家开展学术交流和合作、教育和培训的基地。