主要刊登整体植物科学和植物多样性研究及其相关领域具有创新性或较高学术水平的原始论文和简报；植物学领域的新发现及具有重大应用价值的新成果快报；结合本人工作，反映本学科重要领域的国内外最新研究进展的综述（以约稿为主）。设有植物系统学与生物地理学、植物化学与
化学生物学、生物多样性保护与民族植物学、
植物生态学与
资源管理、植物生理与分子生物学、资讯与书评6个专栏，并接受交叉学科研究论文。
《云南植物研究》是
中国科学院主管、
中国科学院昆明植物研究所主办的全国性植物学专业学术刊物，是中国自然科学核心期刊之一。主要刊登植物学各学科具有创新性或较高学术水平的原始论文和简报；植物学领域的新发现及重大应用价值的新成果快报；结合本人工作，反映本学科重要领域的国内外最新研究进展的综述等。