云冈研究院是山西省人民政府直属事业单位，拥有国家文物局重点科研基地1个。专门负责
云冈石窟保护、研究与管理工作，前身是1952年9月成立“大同市古迹保养所”。
云冈研究院下设文化遗产保护与监测中心、文化遗产艺术研究中心、历史与民族融合研究中心、考古研究所、数字化保护中心、文献资料中心、文旅融合发展中心等10个内设机构。拥有国家文物局重点科研基地1个。
截至2023年5月，云冈研究院下属“数字云冈”先进计算中心，已完成云冈石窟一半洞窟数字化采集工作。通过汇集系统的科学数据，可以更好促进云冈学研究资料开放共享，推动云冈学数字化工作向智能化发展。