天地处于“混沌”状态,有“盘古”生于其间。盘古身体不断成长,原来的混沌状态不能容纳其身体而分裂,“清气”上升为天,“浊气”沉降为地。盘古死后,其精、气、神分化成三位大神,分别为伏羲、神农、女娲。被称为“三皇”。盘古之心悬于天地之间成为连接天地的纽带,并与天界清气所钟之地连接,因清浊交汇而生“神树”,成为天界生命之源。因天地间生灵太少,三皇分别以不同形式创造生灵。伏羲以神树吸收神界清气所结的果实为躯体,注入自己强大的精力,创造出“神”。由于神树果实来源稀少,因此神的数量极少,但灵力强大。神不耐大地浊气,因此居于天,形成“神界”。神虽然有男女之分,但交合繁衍后神本体会失去灵力逐渐死亡,并不能增加神的数量,因此被严禁交合繁衍。
昆仑八派之一的琼华派创立。琼华一派世代信奉九天玄女,素以铸剑秘术为尊,凭借手中三尺青锋纵横山川,除妖荡魔,为方圆百姓所敬仰,也不失为一修仙大派,与蜀山、蓬莱齐名。琼华弟子说过:我派先祖于梦中得到了九天玄女娘娘的指引创造出了“人剑合一”这套剑法。琼华派一年四季如春的风景还有净天房中天珠也是九天玄女赐下的。
琼华派屠戮幻瞑界取得巨大的灵力,欲飞升至昆仑天光成仙。在琼华派飞升就要接近昆仑天光处,九天玄女奉天帝之命下凡向琼华派传递旨意:因琼华派逆天行事,犯下滔天罪孽,令其受天火焚烧,陨落大地,而派中弟子被打入东海漩涡并囚禁千年,同时,因
慕容紫英、
云天河和
韩菱纱三人心存清明善念,故可免去此劫。
玄霄不服,认为神界视人命如草芥,九天玄女则表示万物自有因果,神界是代天授命,维持天道不坠。琼华派人心成魔,无法成仙。玄霄不听,想要动手,九天玄女制服了他,而一旁的夙瑶仍不理解,琼华派除妖降魔竟毫无功德。九天玄女让她想想欲修仙道,先修人道的道理。夙瑶大彻大悟,甘心受罚;九天玄女见她真的知错,便宽大处理,让她被囚禁五百年后再入轮回。
云天河对九天玄女说一旦琼华派坠落,会殃及山下的百姓,何其无辜。九天玄女只道自有因果,天意难违。玄霄笑神界自比天地,草菅人命,并立誓成魔。九天玄女见玄霄心魔已成,日后必成祸端,便将他打入东海漩涡最深处后另禀天帝再议生杀。天河见九天玄女要回神界,喊住她想求一个解决办法,表示我命由我不由天。九天玄女明白了为何
衔烛之龙和
句芒会对他另眼相看,于是提点他身负神龙之息和
后羿射日弓,能否扭转乾坤由他而定。随后,回归神界。
在由
姚壮宪监制、
管平潮执笔的《
仙剑奇侠传》官方小说中,对于九天玄女的身份与经历进行了一系列设定。