干燥的内陆性气候,
年平均降雨量350~400毫米,蒸发量1,550毫米。平均气温-0.9℃(7月平均最高气温20.0℃,1月最低-40.5℃),平均风速4.1米/秒。
迁徙水禽包括天鹅、雁鸭类和三种鹤:
丹顶鹤、
白枕鹤、
蓑羽鹤的重要繁殖地和驿站。大鸨在周围平原上繁殖。 其它动物哺乳类包括
狼、
赤狐、
草兔、
旱獭和
黄羊。
乌拉盖沼泽区被环保总局确定为 “中国重要湿地”。乌拉盖湿地水源补给全靠乌拉盖水系,维持了千百年,乌拉盖水系全部是内流河, 包括乌拉盖河、巴拉根河、高力罕河、锡林郭勒河等。 乌拉盖河年径流量1.45亿m3,占乌拉盖水系的58.4%,是乌拉盖湿地的主要补给水源。
2003年内陆河-乌拉盖河水被完全截断,2005年,内蒙古著名的乌拉盖湿地干涸,乌拉盖河流域土地荒漠化触目惊心,野生动物包括国家一、二类保护动物丹顶鹤、金雕、狼已经几乎绝迹。