大多数的发生的免疫疾病主要可以分成两大项。一是
免疫系统防卫上的缺陷，在这部分发生缺损，将无法产生适应免疫反应上的疾病（如慢性肉芽肿 chronic granulomatous disease）和自体免疫反应（autoimmunity），也就是免疫系统攻击自己的抗原（比方说红斑性狼疮systemic lupus erythematosus、关节炎rheumatoid arthritis或重症性无力症 myasthenia gravis等疾病）。另一个则是因为其他免疫系统发生病变，包括引起各式的过敏反应，例如对于无害分子化合物的产生反应（如气喘asthma、过敏allergies）或是反应过渡激烈。
艾滋病(AIDS)即是著名的免疫系统疾病，其由HIV病毒所引起。目前了解，艾滋病导因于因HIV病毒感染后，失去 CD4+（CD4阳性）T细胞（
辅助T细胞）及
巨噬细胞。
临床免疫学也研究许多方法，来避免许多器官组织移植上所引起的过渡激烈免疫反应。如：避免同种移植allograft或是异种移植xenograft后被
免疫系统所排斥、破坏。
《临床免疫学》由在临床免疫学领域实践经验丰富、学术造诣精深的国内高等院校相关专业的顶尖专家、教授们呕心沥血，在百忙中花费了大量时间和精力精心策划和撰写。《临床免疫学》力图充分反映改革开放以来教学改革的成果，引进了临床免疫学相关疾病的病例等相关内容，目的是进一步培养医学生的实践能力和创新思维。每个章节中推荐了相关的中英文参考文献，给学生留有自学的空间，培养和提高学生的自学能力和思维能力。在部分章节中，作者对总结、概括、公认的诊断标准，公认的新理论、研究热点等用特殊格式标明（在文字外围加方框），重点突出，便于读者掌握。