中正纪念堂站，副站名“南门”，位于台北市中正区，为台北捷运淡水信义线与松山新店线交会的捷运车站。在小南门线尚未与新店线整并为松山新店线前，该站曾是台北捷运第一个三线交会车站，而兴建中的万大线端点站亦设于此，通车后本站将再次成为三线交会车站。

站名取自所在地东北侧著名名胜及明显公共建物“中正纪念堂”。车站位于罗斯福路一段中正区龙福里与新营里交界处，与南海路、林森南路的交叉口以及爱国东西路口间，代码为R08/G10/LG01；万大线车站则预定设于南海路地下。

本站临近台北府城南门（丽正门），附近亦有南门市场，故在以括号加注“南门”副站名。本站出入口也加注副站名，开台北捷运加注副站名之先例。

2018年夏季台北捷运于部分车站新增日本语到站广播，中正纪念堂站以音读“ちゅうせいきねんどう”广播。

淡水信义线、松山新店线：地下三层车站，为岛式叠式月台之跨月台转车站，两个岛式月台分别位于地下第二层与第三层两月台层间上下平行重叠，七个出入口，本站设有半高式月台门。由于车站地下一楼（穿堂层）至二楼（月台层）采整体挑高设计，因此穿堂层被分为南北两部分，两侧大厅及南北两侧出入口（出口1～4、出口5～7）无法经由穿堂层相通。

万大线：地下二层车站，二个岛式月台，二个出入口。

本站南端设有渡线联络淡水线及新店线之轨道，使其余高运量路线列车经新店线或小南门线抵达该站后，得以换轨至淡水线，前往北投机厂进行大型维修作业。

※中和线与新芦线贯通前，中和线、新店线往来淡水线都是透过本站南侧的横渡线进入本站淡水线一月台、三月台运行，2012年9月30日起橘线贯通后，中和线不再与淡水线直通行驶。

※中和线列车初期先由古亭站南侧横渡线进入新店线，再由本站南侧横渡线进入淡水线。

※小南门线在2000年通车后，以本站为端点站（二月台、四月台皆为上行往西门方向，月台每四个月轮替开放）。2013年3月24日起，二月台配合出口1改建工程暂不使用，四月台暂时作为小南门线的端点站，直到2013年11月24日信义线通车后二月台恢复开放为上行月台，四月台则固定为下行月台，原行驶至本站的小南门线列车向南延驶至新店线台电大楼站。

※松山线通车前，新店线透过本站南端的横渡线跨入淡水线直通行驶；2014年11月15日松山线开通起，新店线改直行小南门线至松山线。本站所有月台恢复原设计的列车方向停靠，新店线列车改透过二月台、四月台往来本站。

本站一、三月台的LED跑马灯随信义线通车后，使用与信义线路段相同的LED跑马灯与电子看板。 本站二、四月台的跑马灯则使用新店线路段的新型跑马灯与电子看板。

出口1～4位于车站南端、出口5～7位于车站北端，无障碍电梯位于出口1、出口5。其中有两个电梯于出口1位于南端，出口5位于北端。

出口1为了配合万大线施工于2013年3月24日进行改建。由于未来南海路下方的万大线站体启用后，为了与红线、绿线进行站内转乘，其付费区将透过通道连接至现有车站B1南侧大厅。届时横越南海路下方的出口1必须移位，并加建电梯和手扶梯连接地面和车站，暂时封闭出口一及二号月台上方部分空间，穿堂层靠近出口一的付费区未来预留通道通往万大树林线，一号出口也设置独立进出站闸门。此工程已经完工于2014年10月8日重新启用开放。

1997年至2014年捷运中正纪念堂站的营运模式