中山大学药学院（深圳）是
中山大学深圳校区首批建设的学院之一，作为中山大学优势医科布局深圳校区的重要组成部分，核心和主旨是创新药物研究。
着眼于现代药学学科的建立，聚焦于创新药物研究，利用快速发展的
现代生命科学和生物技术，为药学发展提供崭新的机遇；同时将以生物驱使的创新药学为发展方向，而不是以化学驱使的传统药学，聚焦在转化研究，推动具有原创性、突破性、领先世界的重大发现和技术创新成果的产出。学院将重点布局和建设药物化学、药理学、临床药学、药剂学、生药学、
药物分析学、微生物与生物技术药物学、
化学生物学、社会与管理药学等学科方向。
药学院（深圳）将是一个由国际知名学者组建的新学院。学院人才聘用不拘一格，不分任何国籍，我们立志把学院建设成为一个国际化的创新环境。药学院（深圳）将在2017年内建成包括约10位学科带头人、约50名专职科研系列人员和博士后究人员组成的教学科研队伍。在五年建设期内（2016-2020年），建立起高层次的领军人才与学术带头人、青年学术骨干、实验技术人员等不同层次和不同方向的的人才梯队，“以最优秀的人培养更优秀的人”。
主体平台是创新药物，包括小分子和大分子药物（特别是抗体，抗体药物偶联物，RNA药，生物类似物,疫苗、分子诊断试剂、临床测试试剂、基因药物、多肽药物、基因芯片、蛋白质芯片、基因治疗、干细胞治疗、现代中药、海洋生物医药的创新技术与产品等）。在深圳校区建设正式完成之前，学院将在广州校区东校园建设临时实验室约3000平方米，购置先进的科研仪器设备，拟建立公共科研平台5个。1. 公共平台（基本的实验仪器设备）；2. 细胞平台（干细胞实验仪器设备）；3. 基因平台（基因编辑筛选平台仪器设备）；4. 药效平台（药效评价的实验仪器设备）；5. 药代平台（药物代谢的测试实验仪器设备）。
中山大学药学院（深圳）将坚持三个面向（面向国际学术前沿、面向国家重大战略需求、面向国家和区域经济社会发展），通过“三大”（大团队、大项目、大平台）建设，进一步提升中山大学药学一级学科的整体水平。学院将紧紧抓住三个把握（把握国际创新药物研发的新进展、把握社会需求推动研发模式转变的新动向、把握学科交叉融合推动研发的新趋势），以生物医药药物信息学为主导，以国际前沿的致病机理研究、高水平核心技术创新与集成为核心，致力于构筑生物医药的创新研究实体和关键核心技术的研发平台，提高生物医药研发和产业化水平，为深圳市重点产业（生物医药）提供强大的人力和科技支持，促进深圳市相关产业结构转型升级，成为吸引、培养和造就具有国际先进水平的中国生物医药行业领军人才的平台，成为国家生物医药体系中的重要组成部分。