民国23年迁北平，原中华教育文化基金董事会社会调查部并入该所。民国24年迁南京，所址南京成贤街57号中央研究院内。先后任或兼任所长的有：杨端六、蔡元培、杨铨、傅斯年、陶盂和。下设民族学、经济学、社会学、法制学四组。高级研究人员包括钱俊瑞、罗尔纲、巫宝三、陈翰笙、严中平、樊宏、罗志儒等。
抗日战争爆发后，迁往四川南溪。民国34年更名为社会研究所。民国35年迁返南京原址。研究工作分为经济史、工业经济、农业经济、国际贸易、银行金融、财政、社会生活状况等科目。尤以20年代末、30年代初的无锡农村调查、广东农村调查、上海杨树浦工人生活调查、东北难民调查最有影响。抗日战争期间，从事战时经济、战时损失、沦陷区经济的调查研究，写出了一批调查报告和专著。民国38年，该所随中央研究院迁往台湾。