1999年中央民族工作会议，是第二次由中央召开的民族会议，会议于1999年9月29日至10月3日在北京召开，因正值新中国成立50周年前夕，此次中央民族工作会议与全国
民族团结进步表彰大会合起来，在国庆50周年期间召开。
临近世纪之交，新中国成立50周年前夕，在党的民族政策的正确指引和各族干部群众的共同努力下，我国的少数民族和民族地区经济社会发展已取得了较好成绩。为充分展示
中华民族团结一心跨越新世纪的精神风貌，党中央、国务院决定将此次中央民族工作会议与全国民族团结进步表彰大会合起来，在国庆50周年期间召开。
会上指出，事实充分说明了我们的民族政策是完全正确的，与世界其他国家相比，我们处理民族问题也是最成功的。同时强调了新中国的民族工作主要有两大历史任务：通过进行社会制度的变革，引导翻身解放的各民族人民走上社会主义道路；通过进行社会主义建设，加快各民族特别是少数民族和民族地区的经济社会发展，促进各民族的共同繁荣。
江泽民同志在会议上强调：“全党同志必须把加强民族团结、促进各民族共同发展和共同繁荣，作为整个社会主义初级阶段民族工作的行动纲领。”
时任国务院总理
朱镕基在大会的闭幕式上，就加快少数民族和民族地区发展提出了五点意见。
这次中央民族工作会议充分展示中华民族团结一心跨越新世纪的精神风貌；会议吹响了加快少数民族和民族地区经济社会发展的号角。从2001年开始实施的《中国农村扶贫开发纲要》，再次把民族地区确定为重点扶持对象。同时，西藏整体被列入国家扶贫开发重点扶持范围。2003年，国家对内蒙古、新疆、广西、宁夏、西藏等5个自治区卫生专项投入资金累计达13.7亿元人民币，主要覆盖公共卫生体系建设、农村卫生基础设施建设、专科医院建设、农村合作医疗、重大疾病控制等方面。