1999年5月，团中央、科技部联合下发了《关于共同实施中国青年科技创新行动的意见》，中国青年科技创新行动开始实施。1999年12月，共青团十四届三中全会讨论通过了《共青团中央关于大力推进中国青年科技创新行动为全面实施科教兴国战略作贡献的决定》，中国青年科技创新行动作为全团的重点工作全面开展。1999年7月、2001年3月和2003年10月，团中央、全国青联命名建立了三批86个中国青年科技创新行动教育基地和142个中国青年科技创新行动示范基地，为青年科技创新行动的开展提供了阵地依托。2000年4月，全国青联与亿阳集团共同设立了“中国青年科技创新行动”亿阳基金，为活动的顺利实施提供了有力保障。几年来，团中央、全国青联以中国青年科技创新行动为统揽，大力实施“金桥计划”，通过组织百名博士西部行、“科技之光”百名青年专家服务团、
博士服务团、
海外学人回国创业周等活动，以项目合作、技术支持、科技论坛、成果发布、咨询论证以及挂职锻炼等方式开展服务与合作，累计发布科技成果近10000项，达成意向性项目协议近2000项，协议金额2亿多元。
各级共青团、青联组织积极响应团中央、全国青联的号召，高度重视、不断创新，采取多种形式为不同领域、不同层次青年科技工作者的创新实践提供了切实有效的服务，在大专院校、科研院所与企业、园区之间，东部地区与西部地区之间，海外学人与国内建设之间架起了人才与项目对接、成果与市场联系的桥梁，促进了科研与产业的紧密结合，为进一步推进我国经济社会的发展，为全面建设小康社会作出了积极的贡献。