中国林业科学研究院湿地研究所挂靠于中国林科院林业新技术研究所，为中国林业科学研究院直属专门从事湿地科学基础理论与应用技术研究的非法人独立科研机构。

2009年11月30日，中国林业科学研究院湿地研究所成立，挂靠于中国林科院林业新技术研究所。

2011年1月，与北京市园林绿化局共建北京湿地中心。4月，湿地研究所成立党支部。5月，研究所第一批博士后出站。11月，加盟中美绿色合作伙伴（湿地研究）。

2012年6月，内蒙古包头黄河湿地生态系统定位研究站通过现场考察。

2017年2月，“湿地生态功能与恢复北京市重点实验室”通过北京市重点实验室和北京市工程技术研究中心绩效考评。

2018年11月，中国科普作家协会生态科普创作专业委员会成立，挂靠于研究所。

截至2019年12月，中国林业科学研究院湿地研究所有人员47人，主要来自中国科学院、复旦大学、武汉大学、北京师范大学、悉尼大学和查尔斯特大学，以及全国农林高等院校和科研院所，76%的人员年龄在40岁以下；85%以上具有博士学位。拥有研究员4人，副研（高工）17人；拥有中组部·科技部“中青年科技创新领军人才”、中组部“万人计划”、人社部“百千万人才工程”国家级人选、“科技北京百名领军人才培养工程”、国家林业和草原局“百千万人才工程”省部级人选等科技创新人才。

中组部首批“万人计划”科技创新领军人才：崔丽娟

人社部“百千万人才工程”国家级人选：崔丽娟

科技部“中青年科技创新领军人才”：崔丽娟

科技北京领军人才培养工程：崔丽娟

国家林草局百千万人才工程省部级人选：张曼胤

中国林科院优秀青年创新人才培育计划：李勇

根据2020年4月研究所官网显示，中国林业科学研究院湿地研究所下设5个研究室，此外设有4个国家级湿地生态定位站与1个院级生态定位站。

国家级科研中心：中国湿地生态系统定位研究网络中心

国家级湿地生态定位站：四川若尔盖高寒、北京汉石桥、河北衡水湖、广东湛江红树林

省部级科研中心：北京湿地中心

省部级重点实验室：湿地生态功能与恢复北京市重点实验室

院级湿地生态定位站：河北雄安新区

所属科研部门：湿地景观设计研究室、湿地恢复研究室、湿地生态过程与环境效应研究室、湿地规划与管理研究室、生物多样性研究室

截至2019年12月，中国林业科学研究院湿地研究所先后承担了科学技术部、国家自然科学基金委员会、国家林业和草原局、北京市科学技术委员会等批准下达的科研项目240多项，获得国家科技进步奖二等奖1项、省部级奖21项；发表学术论文430余篇，出版专著20多部，发布标准、获授权专利等100余项（件）。

截至2019年12月，中国林业科学研究院湿地研究所曾获国家林业局全国生态建设突出贡献先进集体称号；连续三年获全国党建研究会科研院所专委会优秀课题二等奖；在国家林业和草原局以及中国林科院各类比赛中获得各项奖励30多项；1人次获得国家林业局优秀共产党员称号，《创新“一二三四”增强支部活力》作为基层党组织活动案例刊登于《紫光阁》。

截至2019年12月，中国林业科学研究院湿地研究所拥有湿地生态学、动物生态学2个二级学科；设有博士后流动站。

学术学位授权二级学科硕士点：湿地生态学、动物生态学

学术学位授权二级学科博士点：湿地生态学

专业学位硕士授权类别：风景园林

博士后科研流动站：湿地研究所博士后流动站

截至2019年12月，中国林业科学研究院湿地研究所共培养博士后和博士、硕士研究生50余人；在站博士后、在读博士和硕士研究生近30人。

根据2020年4月研究院招生简章显示，中国林业科学研究院所有录取为全日制非定向硕士研究生在规定学习年限内均可享受10200元/年的国家助学金，不低于9600元/年的科研补贴；一年级均可享受10000元/年的学业奖学金，二年级（含）以上根据评选，分为一等奖学金10000元/年，占参评人数的40%，二等奖8000元/年，占参评人数的40%，三等奖6000元/年，占参评人数的20%。优秀的硕士研究生还可以申请获得国家奖学金、优秀研究生奖、优秀研究生干部奖、优秀毕业生奖以及专项奖学金等。

根据2020年4月研究院招生简章显示，中国林业科学研究院非定向博士研究生在校期间均可享受19200元/人·年的国家助学金，发放期限从入学当年9月至按学制年限毕业的当月；科研补贴的发放以研究生培养单位的相关规定为准，但不低于1000元/人·月。非定向博士研究生在一年级可享受12000元/年的学业奖学金，二年级（含）以上根据评选，分为一等奖学金12000元/年，占参评人数的50%，二等奖10000元/年，占参评人数的50%。硕博连读研究生在进入博士学习阶段后，可享受10000元/人的硕博连读奖学金。在学术和研究生活动中表现优异的博士研究生可以申请30000元/年的国家奖学金、优秀学位论文、专项奖学金等；并可评选优秀研究生、优秀研究生干部、优秀毕业生等。对家庭经济有困难的研究生，可申请困难补助和勤工助学。

中国林业科学研究院湿地研究所形象标识将湿地三元素抽象与具体有机结合，外环为研究所中英文全称，内环为“白鹤（水生生物）、湿地（土壤）、河流（水）”三元素的结合。

目标：致力于建设亚洲一流的专业研究团队，成为国家湿地研究的知识库、技术库、人才库、智囊团。

宗旨：开展湿地科学基础理论与应用技术，引领中国湿地科学研究的发展方向，为国家湿地保护管理提供决策依据和科学指导