中国木偶剧院隶属于
北京市文化局，为经营性的文化事业单位。在深化
文化体制改革的大潮中，北京市文化设施运营管理中心与北京永庄文化传媒有限公司共同出资对剧团和剧院进行重组，于2006年8月正式注册，9月15日挂牌成立，是第一个国有艺术剧院团与民营企业联手，并由民营资本控股的现代文化企业。
新编原创奇幻剧《
猴王》第一部《
花果山皇帝的新装》、《拇指姑娘和青蛙王子》在北京和全国各地演出500余场。课本木偶戏《
东郭先生》、《小羊过河》使传统木偶艺术焕发了青春。双语魔幻木偶戏《
三只小猪》、《
小红帽》、《万圣节的故事》为儿童提供了既可以看演出，还可以学英语的文化大餐。