《中国医学科学院学报》创刊于1979年2月，是由
中华人民共和国卫生部主管，
中国医学科学院、
北京协和医学院主办的中国国内外公开发行的综合性医学学术性期刊。
办刊历史
1979年2月，为了及时报道中国医学科学院医药卫生科技人员在科学研究、疾病防治等方面的成果和经验，提高医科院医药卫生工作水平，加强中国国内外的学术交流，经中华人民共和国国家科学技术委员会批准，创办了《中国医学科学院学报》。
1980年，从第3期开始，《中国医学科学院学报》开始在中国国内外公开发行。
1982年，为适应院校科研成果快速增长的需要，《中国医学科学院学报》改为双月刊。
1982年，为体现院校合一的管理体制， 从第4期开始将《中国医学科学院学报》主办单位由中国医学科学院改为中国医学科学院、中国首都医科大学。
1984年，《中国医学科学院学报》封面改为网纹米黄色，中文刊名改用长体美术字；正文改用80克胶版，并增至80页。
1985年，随着中国协和医科大学复名，《中国医学科学院学报》改为中国医学科学院、中国协和医科大学主办。
1988年，为保证学报质量，并加强责任制，从第4期开始刊登责任编辑姓名。同年，为进一步提高学报的学术水平，促进院校科研工作的发展，以适应开放和竞争的需要，《中国医学科学院学报》开始向中国国内外开放，吸收院校外具有重要创新和重大科研成果的论文在学报发表。
2014年12月，该刊成为中国国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。
办刊条件
栏目方向
《中国医学科学院学报》主要报道中国在医学科学领域的最新研究成果，刊登具有中国国内外先进水平的基础医学、临床医学、预防医学、生物医学、药学及与医学有关的边缘学科的高水平、高质量的科研论文。
《中国医学科学院学报》主要设有院士论坛/述评、专家论坛/述评、论著、综述、技术方法、经验交流、研究简报、论著摘要、病例报告、科技消息、书评等栏目。
《中国医学科学院学报》主要读者对象为中国全国高等医学院校、卫生系统科研、教学及医疗单位相关人员，中国国外生物医学领域专家、学者。
人员编制
据2018年11月《中国医学科学院学报》官网显示，《中国医学科学院学报》第四届编辑委员会共有编委28人、顾问7人。
办刊成果
出版发行
据2018年11月16日中国知网显示，《中国医学科学院学报》出版文献共6359篇。
据2018年11月16日万方数据知识服务平台显示，《中国医学科学院学报》载文量为3267篇。
影响因子
据2018年11月16日中国知网显示，《中国医学科学院学报》总被下载681313次、总被引44971次；（2018版）复合影响因子为1.350、（2018版）综合影响因子为1.026。
据2018年11月16日万方数据知识服务平台显示，《中国医学科学院学报》被引量为26049、下载量为232708；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《中国医学科学院学报》影响因子为1.496，在全部统计源期刊（6735种）中排第419名。
收录情况
据2018年11月《中国医学科学院学报》官网显示，《中国医学科学院学报》被美国生物医学文献联机数据库Medline（PubMed、网络版）、荷兰医学文摘数据库（EMBASE）、美国
化学文摘数据库及其《化学文摘》（CA）、世界卫生组织西太平洋地区医学索引（WPRIM）、世界卫生组织《医学增补文摘》光盘数据库（ExtraMED）、波兰《哥白尼索引》（IC）、日本科学技术振兴机构中国文献数据库（JST）、美国《乌利希期刊指南》（UPD）和美国EBSCO学术期刊集成全文数据库（EBSCO-ASP）、
中国科学引文数据库（中国科学院文献情报中心）、中文核心期刊要目总览（1992年第一版、1996年第二版、2000年版、2004年版、2008年版、2011年版、2014年版）（
北京大学图书馆）、
中国科技论文统计源数据库（
中国科学技术信息研究所）、中国科技期刊论文与引文数据库（
中国科学技术信息研究所）、
万方数据资源系统数字化期刊群（
中国科学技术信息研究所）、
中国学术期刊综合评价数据库（中国科学文献计量评价研究中心）、
中国学术期刊网络出版总库（
中国学术期刊（光盘版）电子杂志社）、中国生物医学文献数据库（CBM、
中国医学科学院医学信息研究所）、中文生物医学期刊文献数据库（
中国人民解放军医学图书馆）、
中文科技期刊数据库（科学技术部西南信息中心）、中国生物学文献数据库及其《
中国生物学文摘》和《
中国医学文摘》收录。
荣誉表彰
据2018年11月《中国医学科学院学报》官网显示，《中国医学科学院学报》是中国科技核心期刊、医药卫生类核心期刊。
2001年，入选“中国期刊方阵－双百期刊”。
2004年，获得“第三届国家期刊奖百种重点期刊”及卫计委“首届医药卫生优秀期刊评比一等奖”。
2008年，获得教育部“第二届中国高校精品科技期刊奖”。
2008、2011、2014年，连续三届被科技部“精品科技期刊服务与保障系统项目”评选为“中国精品科技期刊”。
2015年，被国家新闻出版广电总局推荐为“百强报刊”。
文化传统
《中国医学科学院学报》旨在促进医学信息交流，提高医学学术水平。
期刊领导
现任领导
历任领导