中华妈祖文化交流协会是国家批准的首个全国性妈祖文化社团，是海内外妈祖文化机构和妈祖文化研究人员自愿组成的非营利性民间文化社会团体，拥有团体会员376个、个人会员26个。协会以遵守法律政策、崇尚社会道德、团结华夏儿女、促进合作交流、弘扬妈祖文化、传承中华文明为宗旨，致力于学术交流、理论研究、展览展示、宣传推广、国际合作、书刊编辑、专业培训、咨询服务等工作。

在1998年的“纪念湄洲妈祖金身巡游台湾一周年”座谈会上，有部分妈祖文化机构代表提出要成立“世界妈祖信众联谊会”。2002年，在湄洲妈祖祖庙召开的第一次筹备前期工作座谈会上，决定将拟筹建的“世界妈祖信众联谊会”更名为“中华妈祖文化交流协会”。2004年6月，国家民政部批复同意成立“中华妈祖文化交流协会”。它是国家批准的首个全国性妈祖文化社团。它的成立，标志着妈祖现象被正式界定为妈祖文化，有利于团结海内外炎黄子孙；也有利于积极推进海峡两岸民间的交流和合作。

2004年10月31日下午，中华妈祖文化交流协会在莆田湄洲祖庙隆重成立。中共中央政治局常委、全国政协主席贾庆林，国务委员陈至立为协会成立发来贺信。福建省委副书记黄瑞霖，省委常委、宣传部长荆福生等领导到会祝贺。

在成立大会上，全国政协副主席、台盟中央主席张克辉当选为中华妈祖文化交流协会会长，中国侨联主席林兆枢、莆田市人大主任林国良、湄洲妈祖祖庙董事会董事长林金榜、台湾省台中县大甲镇澜宫董事长颜清标、台湾省北港朝天宫董事长蔡永常及天津天后宫管委会主任蔡长奎当选为交流协会副会长，林金榜兼任秘书长，霍英东、马万祺及陈江和先生为中华妈祖文化交流协会名誉会长。

妈祖文化发祥迄今已有1000多年的历史，在漫长的传承演绎进程中，妈祖文化逐步传播至我国沿江、沿海和台港澳地区，并随着华侨、华人的脚印逐步传播到世界五大洲20多个国家。全世界共有5000多个妈祖文化机构，信众近2亿人。

●2004年10月31日，中华妈祖文化交流协会在莆田市隆重成立。选举张克辉为会长，林兆枢、林国良、林金榜、郑铭坤、蔡永常、蔡长奎任副会长，聘请霍英东、马万祺、陈江和、袁锦贵为名誉会长。中共中央政治局常委、全国政协主席贾庆林和国务委员陈至立等领导发来贺信。

●2005年4月19日至20日，金门300多名信众乘坐“东方之星”从金门直航湄洲岛朝拜妈祖。湄洲妈祖祖庙向金门天后宫赠送一尊巨型妈祖石雕像。

●2006年2月26日，协会组织莆田湄洲妈祖祖庙、贤良港天后祖祠和文峰天后宫组团赴台，参加台湾大甲妈祖国际观光文化节活动。

●2006年5月25日，协会举办以“妈祖文化交流与两岸海上直航”为主题的第二届“湄洲妈祖·海峡论坛”。

●2006年5月25日，中央电视台心连心艺术团首次以“两岸情缘”为主题赴莆田湄洲岛慰问演出，妈祖文化成为演出活动一大亮点。

●2006年6月，湄洲妈祖祖庙被国务院公布为第六批全国重点文物保护单位，湄洲妈祖祭典被国务院公布为首批国家级非物质文化遗产代表作。

●2006年9月5日，协会副会长兼秘书长林金榜率湄洲妈祖文化交流团赴新加坡、马来西亚等地，与14家妈祖庙宇开展联谊活动。

●2006年9月19日,首届中华妈祖文化知识竞赛总决赛在天津市举行，来自福建、天津、广东、山东、江苏、台湾、新西兰赛区和湄洲妈祖祖庙共8支代表队参赛。

●2006年9月25日至28日，台湾50多家妈祖庙宇的信众与在大陆台胞信众组成7000多人的庞大进香团到湄洲谒祖，这是迄今最大规模的两岸妈祖文化交流盛事。

●2006年10月30日至31日，协会与福建省炎黄文化研究会联合主办第三届闽台文化学术研讨会，“闽台文化与妈祖信仰”成为重要研讨课题。

●2006年10月31日，妈祖文化旅游对接与合作意向书在第八届中国·湄洲妈祖文化旅游节上签订，意向书由中华两岸旅行协会等台湾旅行界六大公会与莆田市旅游协会共同签订。

●2007年5月15日，马祖岛500多名信众乘坐“台马”号客轮直航湄洲岛，这是50多年来马祖信众首次组团以直航方式来湄洲谒祖进香，开辟了马祖至湄洲朝圣旅游新通道。

●2007年5月27日至31日，协会与台湾妈祖联谊会等联合主办首届“莆台妈祖文化活动周”，内容包括民俗文艺踩街，百队“十音八乐”大汇奏、百场木偶戏大会演等。

●2008年4月3日至13日，协会常务副会长林国良率领妈祖文化百人参访团，应邀赴台观摩大甲妈祖绕境活动，访问各妈祖宫庙，并组织湄洲妈祖祖庙参与协办在台中、台南举行的《妈祖之光》大型文艺晚会。

●2008年4月4日至5日，协会首次组织湄洲妈祖祖庙入岛与台湾大甲镇澜宫联合举办“台湾妈祖文化论坛”。

●2008年4月28日，由协会组织兴建的“海西”传世新景观妈祖阁开阁，该阁总造价3500万元，各界人士捐款2955万元。

●2008年5月，协会发动会员单位和妈祖信众向汶川地震灾区捐款捐物价值2500多万元。随后，台湾妈祖联谊会又为灾区蒙阳镇捐建一座妈祖幼儿园。

●2008年9月18日，中华妈祖文化研究院在莆田市竣工落成。协会会长张克辉等为中华妈祖文化研究院落成剪彩和授牌。

●2008年8月19日至9月18日，“西海杯”妈祖文化宣传月在莆田举行，内容包括中华妈祖文化研究院作家笔会、《中华妈祖》向台湾扩大发行仪式等13项系列活动。

中华妈祖文化交流协会以促进交流为目的，以繁荣学术为载体，以开展活动为主线，以充实提高为主题，积极深入地推动妈祖文化的遗产保护、资源整合、学术研究、联谊交流、善活动、项目建设等各项工作。为海内外妈祖文化机构和人员开展学术研究、进行联谊交流、弘扬妈祖文化、增进理解共识提供了重要平台。

协会坚持交流建会，构建协会内部经常性工作网络，扩大两岸四地妈祖文化机构和人员间的联谊交流，密切与世界各地的妈祖文化交流；坚持学术强会，促进对妈祖文化的系统研究，开辟湄洲妈祖.海峡论坛，创办协会会刊《中华妈祖》和会报《妈祖之声》；坚持文化立会，加强妈祖文化遗产保护，开发妈祖文化产品，扩大协会对外宣传；坚持慈善兴会，开展奖教助学活动，推动济困扶贫工作，积极参与各项社会公益活动。

中华妈祖文化交流协会是国家级非物质文化遗产代表性项目“妈祖祭典”的保护单位。

2021年3月3日，民政部公布2019年度全国性社会组织评估等级，中华妈祖文化交流协会评估等级为3A级。

中华妈祖文化交流协会会徽，以经纬线和蓝色背景衬托的湄洲妈祖石雕像为中心，周围为黄色外环嵌出一个吉祥结和两羽和平鸽的图案。

2004年10月31 日下午，中华妈祖文化交流协会举行第一次会员大会，大会表决确定了中华妈祖文化交流协会会徽图案。决定以纬线和蓝色背景衬托的湄洲妈祖石雕像为中心，周围为黄色外环嵌出一个吉祥结和两 和平鸽的图案作为中华妈祖文化交流协会会徽。