中华人民共和国江阴海事局前身为交通部长江航政管理局江阴航政站，成立于1966年4月，1981年5月升格为江阴航政处。

1987年，随着江阴港国轮外贸装卸点的设立，江阴航政处开始了涉外海事业务工作。后又经交通部批准，于1993年11月25日成立了“交通部江阴长江港航监督局。2000年12月，根据国务院中编办（2000）48号文批复意见于12月18日成立了中华人民共和国江阴海事局。中华人民共和国江阴海事局隶属于中华人民共和国江苏海事局，实行垂直管理体制，根据法律、法规的授权，负责行使辖区水上安全监督、防止船舶污染、口岸开放监管和行政执法等职能。

通航水域管辖范围为：长江干线上界桃花港至界河连线，下界至大河港与螃蜞港连线，约35公里水域。陆域管辖范围为：南岸江阴市桃花港至江阴市与张家港市行政区划界线，约38公里长江岸线；北岸为靖江市行政辖区内上六圩港至老十圩港陆域，约11.1公里长江岸线。

江阴海事局有内设机构9个，内设机构的办事机构1个，派出机构6个。内设机构分别为：办公室、党群工作部、纪检监察室、财务会计处、装备与信息处、监管处、督察处、指挥中心（VTS）和规费征稽办公室；内设机构的办事机构为：政务中心；派出机构分别为：执法支队、利港海事处、黄田港海事处、长山海事处、靖江园区办事处和石庄海事处（筹）。江阴市水上搜救中心办公室设在江阴海事局，承担市水上搜救中心的日常管理和协调工作。江阴海事局现有5个水上执法基地（应急待命点），5艘海巡艇，5艘海事趸船，14台执法车。