中共新疆维吾尔自治区委员会党校创建于1950年3月，其前身为中共中央新疆分局地方干部训练班、分局党校。1956年，定名为中共新疆维吾尔自治区委员会党校。

新疆行政学院于2000年9月成立，与自治区党校实行“两块牌子、一套班子”的体制。目前校委成员7人，自治区党委副书记、自治区党务副主席杨刚同志兼任校长。内设处级机构31个，人员编制545人。现有教职工481人，其中参照公务员175人，事业人员306人，离退休人员232人。设有哲学、经济学、政治学、行政学、法学、民族宗教理论、党史党建、文化学教研部等8个教研部和新疆经济社会发展研究中心。专职教师118名，其中教授12人，副教授55人，讲师32人。

校园占地面积54386平方米（合82亩），总建筑面积10.9万多平方米，公用建筑面积7.2万多平方米。现有教学活动中心一座，建筑面积8341平方米，集远程教学、多媒体教学、礼堂、文化健身娱乐设施为一体；教学并学员公寓楼4座，建筑面积4.7万多平方米；图书馆一座，建筑面积6003平方米，藏书23万余册、期刊1300多种。

建校以来，我们认真贯彻中央关于党校工作的指示，围绕自治区党委、政府的中心工作，在新疆民主改革、社会主义建设和改革开放各个历史时期，培养了一批批各民族领导干部和理论人才。党的十六大以来，我们深入贯彻落实科学发展观，形成并不断完善“以教学为中心、科研为基础、信息化为手段、文化建设为支撑、党建工作为保证、行政后勤为保障”的工作布局，坚持服务新疆发展稳定大局，以增强学员思想政治素质、提高领导水平和执政能力为重点，不断深化改革，转变教学理念，改进教学方法，创新培训模式，提高教学质量。目前，常规班次年培训规模2000人左右，短期专题培训约4000人，研究生在校学员700余人，干部继续教育和社会培训约3000人。

经过60年的发展和几代人的努力，自治区党校及行政学院形成了较为完整、具有鲜明特色的学科体系。马克思主义基本理论各学科有较长的历史和较好的基础，其中经济学、民族宗教理论与政策、中共党史和党建是最具特色、最具发展潜力和优势的学科。随着理论研究的深入和国家公务员培训的开展，公共管理、法学、政治学等学科也显示出较强的发展活力。培养造就了一批思想政治素质较高、在区内外具有一定影响的教学科研队伍，专职教师中教授占10.2%；副教授46.6%；中级职称27.1%，已毕业和在读博士17人；另有兼职教师12人，客座教授30多人。1978年以来，共发表论文4200多篇，出版专著、教材、译著等200多部，承担并完成国家课题16项，省部级课题60项，获国家和省部级各类科研奖140项。形成了以培训轮训县以上党政领导干部为主体，以研究生教育和继续教育、社会培训为两翼的办学格局。60年来，培训主体班次学员20余万人，本科和函授学历教育近10万人，研究生近2000余人。