东夷校尉府亦称护东夷校尉府。汉置，
辽东地区的最高军事长官，秩比二千石，掌护抚鲜卑，由护乌桓校尉府分出。《后汉书·百官志五》：“护乌桓校尉一人，比二千石，本注曰：主乌桓胡。”注：“应劭《汉官》曰：拥节，长史一人，司马二人，皆六百石，并领鲜卑。《晋书》曰：汉置东夷校尉，以抚鲜卑。”
曹魏初年一度在襄平设置东夷校尉，统帅辽东、昌黎、玄菟、带方、乐浪五郡，承认公孙度自立的平州，由其世袭管理，后撤销，其地划归幽州。及司马懿灭公孙渊后，重新设立护东夷校尉，居襄平，负责统领东北各民族。
东晋太兴初年，末任东夷校尉崔毖被慕容廆逼走，逃入高句丽。北魏世祖拓跋焘于延和四年（435年）封高句丽长寿王的封号中包括护东夷中郎将，后历代高句丽国王的封号中均有类似官职。