上海科技大学免疫化学研究所隶属于上海科技大学, 成立于2012年10月12日，创始所长是免疫化学理论的奠基人理查德·乐纳教授。研究所由上海科技大学和中国科学院上海高等研究院共建。研究所秉承追求卓越和开拓创新的理念，以免疫化学基础理论为核心，专注抗体技术和药物研发。

免疫化学、细胞生物学、计算生物学及人工智能、结构生物化学

2012年10月12日上午，上海科技大学免疫化学研究所揭牌仪式在中国科学院上海浦东科技园举行。

抗体设计学实验室

抗体化学实验室

功能筛选实验室

结构生物化学实验室

干细胞生物学实验室

病原生物学实验室

蛋白质机器与新药实验室

计算生物学实验室

感染与抗感染实验室

大分子药物递呈实验室

再生医学与神经修复实验室

细胞钙信号实验室

干细胞和表观遗传学实验室

药物设计与研发实验室

基因组空间结构实验室

免疫化学生物学实验室

生物能量学实验室

癌症干细胞实验室

抗结核研究实验室

膜蛋白研究实验室

神经退行性疾病转化研究实验室

病毒感染与免疫实验室

药物发现平台

生物医学大数据平台

分析化学平台

生物电镜平台

免疫化学研究所现有21位课题组长，包括11位特聘教授（Distinguished Adjunct Professors）、9位全职教授/研究员（Full Time Professors）及1位访问教授（Visiting Professors）。研究课题聚焦于免疫化学、细胞生物学、结构生物化学、计算生物学与人工智能四大研究方向。

创始所长：理查德·乐纳（Richard A. Lerner）

执行所长：杨海涛

助理所长：雷颖

研究所将针对各项人类重大疾病，开展人源细胞表面的免疫抗原图谱的制作构建高效重组人源抗体库筛选可用于临床治疗的新型单克隆抗体和药物靶点，并建立抗体的体外重组和优化技术平台。

研究所致力于打造基础研究和临床应用相结合医学研究和生物技术产业相结合的多功能交叉基地创新型生物医药产业和免疫化学高端人才培养的研发基地，培养中国未来的从事免疫化学相关基础研究和临床应用的人才，同时带动治疗性抗体的研发，形成治疗性抗体的产业化。

2021年10月，被授予“2021年上海市工人先锋号”称号。

2023年9月，上海科技大学免疫化学研究所执行所长杨海涛获得第八届“中源协和生命医学创新突破奖”。