由上海国际港务（集团）股份有限公司投资组建，于 2005 年 5 月 31 日 注册成立。公司注册资本人民币 50 亿元。公司主要负责经营管理洋山深水港区一期、二期码头，并投资经营与之配套的深水港国际物流园区。

洋山一期码头于 2005 年 12 月 10 日 正式开港，生产效率不断提升，已达到成熟集装箱码头运作水平，并于开港第一年就一举突破了洋山一期码头 220 万标准箱的年设计吞吐能力。 2006 年 12 月 10 日 ，洋山二期码头顺利开港，一期、二期码头实现合并运作，拥有 3000 米 深水岸线，配备集装箱桥吊 34 台、轮胎吊 120 台以及其它装卸运输设备。

2020年11月，入选第六届全国文明单位名单。

2021年8月，上海盛东国际集装箱码头有限公司信息技术组被命名为“第20届全国青年文明号“。