实验室的定位是立足上海、放眼全国，面向动物产业，围绕遗传与繁育、营养与饲料、卫生与防疫等领域的生物技术，加强基础与应用基础研究，突出特色，注重成果转化及人才培养。建设目标是把实验室建成动物疾病防控、遗传繁育以及饲料生产的高新技术研究基地和成果转化基地。
以小型猪为模型建立了人
肠道菌群、猪链球菌2型、猪异体心脏器官移植等动物模型；基于病毒宏基因组技术，挖掘了一系列噬菌体裂解酶，筛选出裂菌活性强、产量高、性质稳定的裂解酶并解析其酶学特征及活性功能域；以早期断奶应激仔猪为模型，建立了基于抗氧化的缓解仔猪早期断奶应激综合症的新方法；建立了高通量低成本的动物基因组简化与测序技术平台(GGRS)和高效的缺失基因型填补方法(iBLUP)。