上海市交通运输和港口管理局，为市政府直属机构。
主要职责
（一）贯彻执行有关交通运输、港口和航运行业的法律、法规、规章和方针、政策；研究起草有关交通运输、港航管理的地方性法规、规章草案和政策，并组织实施。
（二）根据本市国民经济和社会发展总体规划，负责制定交通运输、港口等发展战略，编制
交通运输专业规划和行业中长期规划并组织实施，编制
上海港口（含洋山
新港区）的总体规划，并组织实施；根据有关法律、法规和规章的规定，负责港口的岸线、陆域、水域行政管理，负责上海港引航监督管理；负责
浦东国际机场、虹桥国际机场等空港地区有关行政管理。
（三）会同市有关部门，组织实施交通运输、港航体制改革工作，研究提出本市交通运输、港航发展的相关政策；参与制定与交通运输、港航相关的经济政策和调控措施；负责编制交通运输、港航年度供应计划、重点基本建设和技术改造计划、科技和信息化发展计划，并监督实施；组织实施国家有关技术标准，起草有关地方技术标准。
（四）会同市有关部门，参与城市道路、公路路政管理；负责协调推进交通枢纽、道路客货运场站、
公共交通站点、公共停车场（库）等的规划建设；负责道路停车管理相关职责；负责上海港口公用基础设施、
内河航道的规划和管理工作，负责内河航道建设立项预审工作；负责客货运输市场的建设和管理。
（五）负责征缴、代征国家和本市规定的涉及交通运输、港口和航运的有关规费和其他费收；提出市管交通运输、港口和航运行业的运价和收费标准，经批准后组织实施；参与对交通运输、港口、内河航道建设市场秩序的监管。
（六）负责对交通运输、港口和航运的行业管理工作，研究制定全市交通运输、港口和航运市场的交易规则、管理制度和管理办法；负责交通运输企业经营资质、新增运力、线路资源配置的审核、审批和招投标管理工作；负责属于地方政府管理权限的国际海上运输、沿海运输和长江运输的行业管理工作；负责沿海、国际航线的备案受理工作。
（七）承担交通运输、港口和航运行业的安全质量监管责任，组织对交通运输、港口和航运行业服务质量的监督检查，对港口建设项目的工程质量、安全实施监督；负责地方海事工作；组织协调交通运输、港口重大突发事件、重大灾害事故和重大服务供应事故的应急处置；承担交通运输、港口和航运行业的经营秩序、安全生产，以及所辖通航水域的卫生防疫、船舶污染防治的监管责任。
（八）负责组织协调本市交通运输、港口和航运设施、机场的配套工作；对交通运输、港口和航运行业市政府实事工程项目实行全过程管理；会同有关部门，组织协调交通运输、港口和航运、机场有关基础设施项目的建设管理；对轨道交通、港口、机场等规划控制区域范围内新建、改建、扩建项目提出意见。
（九）负责专项客货运输的组织协调；负责协调推进联合运输、多式联运等综合运输工作；承担全市无人看守
铁路道口监管责任；参与有关国家重点物资和紧急、特种物资以及军事、抢险救灾物资交通运输的组织协调；参与市域和对外交通以及“春运”期间交通的综合协调。
（十）组织、指导、协调并监督交通运输、港口和航运行业的行政执法工作，组织实施路政执法；加强交通运输、港口和航运行业的国际交流与合作。
（十二）承办市政府交办的其他事项。
内设机构
（一）办公室（信访办公室）
（二）组织人事处
（三）法规处（区县指导处）
（四）财务处
（五）安全监督处
（六）客运处（轨道交通处）
（七）货运处（静态交通处）
（八）港务监管处
（九）航务监管处
（十）引航管理处
（十一）综合规划建设处
（十二）交通保障协调处
（十三）科技信息处
（十四）合作交流处
（十五）洋山港区管理办公室
（十六）空港地区管理处