上海市中医医院位于上海市芷江中路274号，创建于1954年，是一所集医疗、教学、科研为一体的三级综合性中医医院。

上海市中医医院前身为1954年9月1日建立的上海市立中医门诊部。地址榆林区惠民路702号。1956年下放为区属，改名榆林区中医门诊部。次年扩充为榆林区中医医院，设床位20张。1959年区划调整后，改名杨浦区中医医院，迁眉州路34号。

1979年划归市卫生局，改称上海市中医医院。1983年，经市计委批准，在闸北区芷江中路274号(市传染病医院旧址)新建门诊大楼、病房大楼，床位设计规模扩大至500张。1990年,有病床169张，职工458人，临床科室14个，医技科室4个，研究室2个，实验室1个。日均门诊1335人次。

1992年3月，从杨浦区迁入芷江中路274号，占地面积23亩,建筑面积3万平方米。1993年，床位184张，职工508人，其中卫技人员388人（医生174人，含正副主任医师36人）。设临床科室20个、医技科室8个、研究室7个、专病专科门诊48个、中医烧伤等特色门诊6个，年门诊39. 59万人次，住院965人。1997年，医院与原上海市中医门诊部合并，组建成新的上海市中医医院。

2005年，成为上海中医药大学非直属附属医院。

2010年，医院的中医儿科被选作国家中管局重点扶植的学科之一，并联合龙华、曙光和岳阳其他3所上海中医药大学附属医院，联合申报成立了中医儿科研究所。

2019年11月，根据静安区委区政府统一部署，医院石门路门诊部迁建工程（昌化路门诊部）顺利开工实施，新院区总建筑面积120000m。

2020年6月，嘉定院区项目正式开工。嘉定院区项目正式开工。

医院设有儿科、脑病科、神志病科、肿瘤科、骨伤科、耳鼻喉科、风湿病科、外科、妇科、急诊科、肺病科、脑病科、肾病科、血液病科、肛肠科、疼痛科、眼科、脾胃病科、药剂科、检验科、功能科、病理科等临床和医技科室。其中，医院拥有卫生部国家临床重点专科3个，国家中医药管理局重点学科2个，国家中医重点专科6个，上海市优势专科2个，上海市传统医学示范中心1个，上海市中医预防保健示范单位1个。另外，设有上海市中医药研究院中医儿科研究所，并与上海市中医药研究院老年病研究所合作成立中医老年病转化医学研究中心，还与上海市中医药学会合作成立上海名老中医学术经验研究中心。

医院开放床位535张，配有MRI、64排128层CT、DR、CR、DSA、大型生化仪、聚焦超声刀、主动康复设备等医疗设备。

2020年9月，获得”上海市抗击新冠肺炎疫情先进集体“荣誉称号。

上海市芷江中路274号。