主要职责是为了真正突现上海在
生命科学和产业的基本研究、小鼠大鼠极其突变品系的保种供应以及对实验动物及其环境设施的质量监督和控制的整体优势；通过开放公共实验室，向高校和科研机构提供的公益性服务以及对外企和国际性的商业化服务；协助上海市科委进行实验动物许可证管理（包括年检、复评审等等）、涉及实验动物的科研项目管理和中长期规划，组织从业人员培训等。经过几年建设，
上海实验动物研究中心完成了啮齿类动物实验服务平台的建设。现拥有大小鼠活体保存品系27个，年可供SPF级清洁动物100万只。实验动物质量监控、研究技术服务，实验动物质量的检测技术与世界同步。中心具有专业研发团队和齐全的检测仪器和设备，为生命科学研究和生物医药产业领域的139个机构提供了12项啮齿类动物专业技术服务。实验动物公共服务平台建设，为本市乃至全国的高等院校，科研院所，医院和生物医药企业的生命科学研究、生物技术创新性研究和新药研发提供关键的支撑条件。