上海国际旅行卫生保健中心（上海海关口岸门诊部）为上海海关所属事业单位。根据《中华人民共和国国境卫生检疫法》及其实施细则，承担着上海口岸出入境人员健康管理的法定工作，是一个集传染病监测、旅行卫生保障、健康体检评估、免疫预防接种、旅行健康咨询、国际医疗救助为一体、拥有先进医疗诊察手段、检测设备和技术力量的综合性医疗保健机构。

中心通过ISO9001:2000质量管理体系认证，中心实验室通过ISO/IEC 17025质量管理体系认可。是世界卫生组织、国际旅行医学协会、亚太旅行卫生学会、美国疾病与预防控制中心、美国移民局、澳大利亚旅行者医学接种中心的合作伙伴。

2020年9月，上海市委、市政府决定，授予其“上海市抗击新冠肺炎疫情先进集体”称号。

2021年12月，上海国际旅行卫生保健中心（上海海关口岸门诊部）被全国科技系统抗击新冠肺炎疫情表彰工作领导小组办公室拟表彰为“ 全国科技系统抗击新冠肺炎疫情先进集体”。