三清殿，占地500平方米，为三重檐攒尖顶楼阁式木构建筑，屋角飞翚；二层施作四个歇山向外、尖端排山、四角飞檐；底层四个单坡出檐。八角飞檐，屋顶富于变化，以地制宜，临山一面亦作简化。殿内供奉
道教三清神像，中为玉清
原始天尊，左为太清
道德天尊，右为上清
灵宝天尊。正殿左房挂着法道字帖，右面则有八挂图表。现殿中有五个道教传士，每日讲经，主持法事活动。
三清殿地处“宫丽之室，拟于王者”的
木府，作为丽江旅游精品景点，游客众多，游人如织。殿内香火旺盛，每年到三清殿来朝拜的人大约20万人次左右，而且每年有增加的趋势。
木府是
丽江古城内的古代宫殿建筑群，原为明代丽江土司衙门的府邸，是当时
丽江地区政治、文化中心，有340多年的历史。素有“北有故宫，南有木府”的美誉。
木府中轴线上依次排列着
议事厅、
万卷楼、
护法殿、
光碧楼、
玉音楼、三清殿等建筑。中轴线两侧建有配殿、阁楼、过街楼、家院、官驿、长廊等共160多间屋舍。