第一章：三律仪总轮；第二章：毗奈耶别解脱戒；第三章：菩萨发心戒；第四章：密乘持明律仪论次第；第五章：总论三律仪次第。总论声闻、独觉、菩萨、事部乘、行部、瑜迦部、大瑜迦、阿鲁瑜迦、阿底瑜迦等九乘的建立过程。
然后分述别解脱戒、菩萨戒和密乘戒等3种律仪的内容及其重要性，要求诸僧恪守戒律，不可违犯。别解脱戒规定，凡僧人应以厌离心为等起，以戒律为重，不损他人利益，从生死轮回的恶趣中解脱出来。菩萨律仪，即菩萨戒，根据
大乘佛教思想规定的戒律，不但自己要求解脱，且有利他之心，断尽损害他人及他人之因，成办利他及利他因。菩萨有十重戒：杀戒、盗戒、淫戒、妄语戒、酤酒戒、说四众戒、自赞毁他戒、悭惜加毁戒、瞠心不受悔戒和谤三宝戒，若犯十戒就会被逐出僧团。密教律仪是受过密乘戒的僧人所持守的防止、止非之戒，有所防护与能防护之分，前者指心境分别观察、迁流习气，后者指守护大乐智慧、殊胜方便所摄心及种子。