1999年之前，进行进出口贸易活动时，外贸企业在向海关申报前，首先要申请商品检验、动植物检疫和卫生检疫，俗称一关三检。 1999年，全国各地的进出口商品检验局、动植物检疫局、卫生检疫局陆续合并，成立各地“出入境检验检疫局”,全名是“中华人民共和国XX出入境检验检疫局”。在国家层面，组建了“
国家出入境检验检疫局”，垂直管理各地的出入境检验检疫局，内地31个省级的检验检疫局和深圳、珠海、厦门、宁波共35个局被称作“直属检验检疫局”，其下隶属的分布在各地各口岸的出入境检验检疫局或办事处被称作“检验检疫分支机构”。