《应用生态学报》创刊于1990年，是由中国科学院主管，中国生态学学会和中国科学院沈阳应用生态研究所主办的综合性学术期刊，学报主要报道应用生态学领域的创新性科研成果与科研进展。

1990年，《应用生态学报》创刊。

2012年，入选中国科协精品科技期刊工程资助项目。

2014年，成为国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

2017年，《应用生态学报》已连续6年入选中国最具国际影响力学术期刊（即TOP50）。

《应用生态学报》主要报道应用生态学领域的创新性科研成果与科研进展。

《应用生态学报》主要设有研究论文、综合评述等栏目，内容主要包括森林生态学、农业生态学、草地生态学、渔业生态学、海洋与湿地生态学、资源生态学、景观生态学、全球变化生态学、城市生态学、产业生态学、生态规划与生态设计、污染生态学、化学生态学、恢复生态学、生态工程学、生物入侵与生物多样性保护生态学、流行病生态学、旅游生态学和生态系统管理等。

《应用生态学报》读者对象主要是从事生态学、地学、林学、农学和环境科学研究、教学、生产的科技工作者，有关专业学生及经济管理和决策部门的工作者。

据2018年4月《应用生态学报》官网显示，《应用生态余学报》第七届编委会共有编委84人。

编委：安树青、白娥、蔡志全、蔡祖聪、陈利顶、陈效民、程方民、代力民、戴廷波、邓建明、葛体达、龚骏、谷孝鸿、管东生、郭建平、郭良栋、韩士杰、郝占庆、郝广友、何芳良、贺红士、何红波、贺纪正、胡聃、胡远满、贾冠清、蒋德安、蒋建东、姜勇、开国银、孔垂华、李凤民、李建龙 、李新正、李志安、梁超、梁文举、林文雄、刘勇、刘建国、刘树华、陆宏芳、陆宴辉、马克明、马男、倪健、潘波、彭长辉、仇荣亮、任海、沈仁芳、史大林、孙永华、孙志高、台培东、王政权、王志恒、魏树和、吴东辉、邬建国、武昕原、谢凌天、谢永宏、徐海君、徐志宏、晏向华、杨健、杨永兴、杨允菲、游静、于红霞、余新晓、宇万太、宇振荣、曾任森、张金林、张锐、张旭东、张一平、赵长明、赵文智、周广胜、周启星、庄杰

据2018年4月中国知网显示，《应用生态学报》出版文献共9378篇。

据2018年4月万方数据显示，《应用生态学报》载文量为8225。

截止2012年12月，《应用生态学报》被“中国期刊方阵”（双效期刊）、“中国科技核心期刊”、“中文核心期刊”，被《中国科学引文数据库》（CSCD，核心期刊）、《中国科技论文与引文数据库》（CSTPCD）、《中国学术期刊综合评价数据库》（CAJCED）、《万方数据库》、《中国期刊全文数据库》（GJFD）、《中国学术期刊全文数据库》、《中文科技期刊文摘数据库》、美国《生物学文摘》（BA）、《化学文摘》（CA）、英国《生态学文摘》（EA）、日本《科学技术文献速报》（CBST）和俄罗斯《文摘杂志》（AJ）等中国内外十多家权威检索系统和数据库收录。

据中国科学技术信息研究所发布的《2016年版.中国科技期刊引证报告（核心版）》，《应用生态学报》2015年影响因子为1.785，在生态学类期刊中排名第1位。

据2018年4月中国知网显示，《应用生态学报》总被下载3879263次、总被引325387次、（2017版）复合影响因子为3.267、（2017版）综合影响因子为2.166。

据2018年4月万方数据显示，《应用生态学报》2015年影响因子为2.11，载文量为8225，被引量为239761，下载量为248695。2015年影响因子排名为全部统计源期刊（6735种）第156名；生物科学（93种）第3名。

1992年，获得中国优秀科技期刊三等奖、中国科学院优秀期刊二等奖。

1996年，再次获得中国科学院优秀期刊二等奖。

2000年，第三次获得中国科学院优秀期刊二等奖。

2004年，获得百种中国杰出学术期刊称号。

反映中国应用生态学的学术水平和发展方向，跟踪学科发展前沿，注重理论与应用结合，促进中国内外学术交流合作与人才培养。