α多样性
生物科学领域术语
α多样性主要关注局域均匀生境下的物种数目,因此也被称为生境内的多样性(within-habitat diversity)
计算公式
多样性指数计算公式如下:(Hill et al., 2003)
(1).克隆文库覆盖率(C):
n为克隆文库中仅一个序列的OTU数,N为单文库中的OTU数。
(2).辛普森指数(D):
1-
N为单个文库中序列数,ni为第i种OTU中包含的序列数,n为单文库中序列数。
(3).香农指数(H):
Pi为第i种OTU中序列数在单文库序列总数中的比例,n为单文库中OUT个数。
(4).均匀度指数(E):
H为香农指数,S为单文库中总序列数。
(5).丰富度指数(Schao1):
Sobs为单文库中OTU个数,F1 和F2分别为克隆文库中只包含1个和2个序列的OTU个数。
参考资料
最新修订时间:2024-05-21 15:08
目录
概述
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