数目可变串联重复序列(Variable Number of Tandem Repeats,VNTR )数目可变串联重复序列又称小卫星DNA (Minisatellite DNA),是一种重复DNA小序列,为10到几百核苷酸,拷贝数10~1000不等。
VNTR基本原理与RFLP大致相同,只是对
限制性内切酶和
DNA探针有特殊要求:(1)限制性内切酶的
酶切位点必须不在重复序列中,以保证小卫星或
微卫星序列的完整性。(2)内切酶在基因组的其他部位有较多酶切位点,则可使卫星序列所在片段含有较少无关序列,通过电泳可充分显示不同长度重复序列片段的多态性。(3)分子杂交所用DNA探针核苷酸序列必须是小卫星序列或微卫星序列,通过分子杂交和
放射自显影后,就可一次性检测到众多小卫星或微卫星位点,得到个体特异性的DNA指纹图谱。 小卫星标记的多态信息含量较高,在17一19之间。缺点是数量有限,而且在基因组上分布不均匀,这就极大限制其在基因定位中的应用。VNTR也存在实验操作繁琐、检测时间长、成本高的缺点。