I-A和I-E亚区产物，在化学方面已研究得很清楚，即糖蛋白，由α肽链（分子量约为35,000）和β肽链（分子量为27,000）以非共价键结合而形成一个分子，在I－A亚区译码为一条α链（Aα）和二条β链[Aβ，Ae（也称Eβ）]，在I－E亚区译码为一条α链。整个是合成Aα－Aβ和Eα－Ae二种Ia抗原。与H－2K，D产物（H－2抗原）不同，只在一定的细胞如B细胞、T细胞部分、巨噬细胞部分、淋巴组织树状细胞、表皮的革兰氏细胞（Langerhans cell）精子等细胞的表面发现。确切的生物学机能，有的认为对与T细胞起协同作用的细胞来说，可作为表示与T细胞来源于同一个体的细胞的标识或与外来抗原结合以自身的变化作为给T细胞以刺激的信息。另外
混合白血球反应中使T细胞识别非自己的Ia抗原。与人的Ia抗原相当的抗原为HLA－D区产物的HLADR抗原。