5-HT约2/3在肝脏与硫酸或葡萄糖醛酸结合后排出，或将吲哚断裂而分解;约1/3经单氨氧化酶作用氧化脱氨形成5-HIAA后从尿排出。5-HIAA是5-羟色氨酸代谢的最终产物，不具有生物活性。
正常值
定性：(新鲜尿)阴性。 定量(尿)：10.5-42.0μmol/24h(2-8mg/24h)
临床意义
阳性(或升高)：类癌瘤综合征、食品和药物(香蕉、西红柿、杏、核桃、茄子、利血平、酚噻嗪衍生物、卢戈氏液)。
注意事项
(1)标本采集后，应立即测定或贮存于冰箱冰冻，但不超过1周。 (2)避免各种可能有影响的药物，测定前1-2天应停服药物以免干扰。