在过去的11周里，美国被一系列的恐怖袭击包围着。被中国特工掳去，在中国监狱里受尽折磨的杰克·鲍尔（
基弗·萨瑟兰饰）被送回美国，以便当局能以他为筹码向“线人”交换恐怖袭击情报。本已麻木接受命运的杰克·鲍尔在明白自己的牺牲将是毫无用处的时候，他开始恢复小强本色，挣扎着逃出生天。但此时的美国本土也首次遭遇了核弹袭击-洛杉矶核弹爆炸，死亡一万人。重返CTU的杰克·鲍尔必须在余下的时间里，找出另外三颗随时待爆的核弹。除了直面更大的危机挑战，肩负拯救世人重任的杰克·鲍尔在这一天更要经受比前五天更痛苦更深层次的煎熬。
《24小时第六季》的幕后最大的BOSS是杰克的父亲和哥哥，美国人与恐怖分子的矛盾，变成鲍家的内部矛盾。为反恐牺牲了全部的杰克，所有的恐怖活动竟然是因他而起。这样的安排实在太不负责任了。编剧们不仅削弱了杰克的光辉形象，更削弱了《反恐24小时》在观众心中的真实感和现实主义风格。此外，该剧在杰克的内心戏以及感情戏比前5季都弱化了；反而，惨不忍睹的逼供和杀人放火场面增加了很多。（《信息时报》评）